A Abeclin é dirigida por uma comissão diretora composta por:
- 01 Presidente;
- 01 Vice-presidente Executivo
- 01 Vice-presidente de Gestão Administrativa
- 01 Vice-presidente de Gestão Financeira
- 01 Vice-presidente de Gestão Marketing e Relações Institucionais;
- 01 Vice-presidente de Desenvolvimento Técnico-científico
Eleição e Mandato
O Vice-presidente é eleito na mesma chapa do Presidente que nomeia os demais. Somente o Presidente e o Vice-presidente eleitos têm poderes administrativos nos termos da lei nº 10.406/02. O Presidente tem um mandato de três anos podendo ser reeleito, uma única vez.